I Femern Bælt regionen finder man en række vigtige storbyer og handelsstæder: Hamborg på den tyske side, Danmarks største by og hovedstad, København, og Sveriges tredjestørste by, Malmø.

Nærområdet omkring Femern Bælt-forbindelsen er relativt tyndt befolket set i forhold til andre dele af regionen. På den ene side af bæltet i Lolland Kommune bor der kun 55 indbyggere pr. kvadratkilometer, og på den anden side i Kreis Ostholstein bor der 148 indbyggere pr. kvadratkilometer. Til sammenligning skal det nævnes, at der i regionens tættest befolkede område, Hamborg, bor 2.316 indbyggere pr. kvadratkilometer.