I løbet af de seneste to år er det blevet mere og mere tydeligt, at de områder, der identificerer sig selv som en del af regionen, er det sydlige Sverige, det østlige Danmark og det nordlige Tyskland. Regionen omfatter altså områderne Region Hovedstaden, Region Sjælland, Schleswig-Holstein, Hamborg, den nordvestlige del af Mecklenburg-Vorpommern (herunder kreise og kreisfreie städte Rostock, Wismar, Bad Doberan, Güstrow og Nordwestmecklenburg) samt Skåne Len.

Femern Bælt regionens areal udgør i alt 60.895 kvadratkilometer (inkl. hele Mecklenburg-Vorpommern). Heraf udgør den tyske del af regionen 65 pct., den danske del udgør 16 pct. og den svenske udgør 19 pct.