Broens struktur vil derfor blive delt op i mindre enheder, så de kan transporteres til deres permanente placering. Det forudses, at bropiller og sænkekasser til bropillerne bliver støbt individuelt på land. Brofagene deles op i elementer, der svarer til afstanden mellem bropillerne. Fundamenterne til selve højbroens pyloner vil blive støbt på land og transporteret til deres permanente placering i bæltet, hvorefter pylonerne støbes in situ. Kajer til udskibning indgår som en del af byggepladserne på Fehmarn og Lolland.
I det foreløbige projekt er broen planlagt som en 9.300 m lang nordlig tilslutningsbro fra den danske side til højbroen, en 3.300 m lang højbro over sejlrenden tættest på den tyske kyst samt en 6.000 m lang sydlig tilslutningsbro til den tyske kyst.