Fartøjet er udstyret med avanceret udstyr til måling af bl.a. strøm, salt og temperatur i havet. Fartøjet er også udstyret med diverse prøveudtagningsudstyr og net til biologiske undersøgelser.

Fartøjet JHC Miljø servicerer mere end 35 automatiske målestationer rundt omkring på havet. Stationer, der ligger i den faste forbindelses planlagte linjeføring og i Mecklenburg Bugt, måler vandets fysiske egenskaber, bl.a. dets iltindhold, saltholdighed og temperatur. Bøjerne når over 25 meter ned i havet og indsamler data for hver anden meter.

Andre stationer, som ligger tæt på Femern Bælts kyster, måler vandets sedimentkoncentration. Andre stationer optager lydsignalerne fra marsvinene i Femern Bælt.

De indsamlede data er en forudsætning for vurderingen af virkningerne på miljøet og for planlægningen af de fremtidige anlægsarbejder til havs.

Undersøgelserne begyndte i slutningen af 2008 og vil løbe over to år.