De fem færger på "Fugleflugtslinjen" mellem Rødby og Puttgarden transporterer i dag ca. to millioner køretøjer om året og et antal passagertog på København-Lübeck-Hamborg linjen.
Den faste forbindelse vil give en række fordele for den generelle trafik i forhold til tid og fleksibilitet. Ventetiden ved færgerne vil blive elimineret, og en tur på tværs af bæltet vil med kun 15 minutters køretid være væsentligt hurtigere end i dag.
Jernbanegodstransporten mellem Tyskland og Danmark har foregået via Storebælt siden 1997. I sammenligning med en tur over Storebælt vil ruten over Femern Bælt være 160 km kortere. Sammen med Øresundsforbindelsen mellem Danmark og Sverige vil Femern Bælt forbindelsen udgøre en vigtig komponent i det nordiske og centraleuropæiske motorvejs- og jernbanenet.